ในช่วงทศวรรษปี 1600 เมล็ดกาแฟส่วนใหญ่มาจากเยเมน เมล็ดกาแฟอยู่ภายใต้การดูแลอย่างเข้มงวด และผู้มีอำนาจก็ทำทุกอย่างที่ทำได้เพื่อให้แน่ใจว่าไม่สามารถปลูกเมล็ดกาแฟที่อุดมสมบูรณ์ได้ที่อื่น อย่างไรก็ตาม บาบา บูดาน ผู้แสวงบุญชาวมุสลิมกำลังจะเปลี่ยนเส้นทางประวัติศาสตร์กาแฟไปตลอดกาล เขาออกจากเมกกะเพื่อกลับไปอินเดียในปี 1600 โดยลักลอบนำเมล็ดกาแฟจำนวนหนึ่ง ด้วยความช่วยเหลือจากอาณานิคมของอังกฤษ ซึ่งสิ่งเหล่านี้ได้กลายเป็นเมล็ดพันธุ์ของ
อุตสาหกรรมกาแฟเชิงพาณิชย์แห่งแรกของโลกนอกแอฟริกาและอาระเบีย ซึ่งยังคงผลิตกาแฟอยู่ในปัจจุบัน
กาแฟได้รับการเผยแพร่อินโดนีเซียเป็นครั้งแรกในช่วงปลายทศวรรษที่ 1600 โดยพ่อค้าชาวดัตช์ หลังจากนั้นกาแฟได้แพร่กระจายไปยังเกาะต่าง ๆ มากมายในอินโดนีเซีย เช่น สุลาเวสี สุมาตรา ชวา และบาหลีในช่วงเวลาสั้น ๆ ทำให้ต่อมาเกาะหลายแห่งในอินโดนีเซียได้กลายเป็นหนึ่งในผู้ผลิตกาแฟชั้นนำของโลก
ประมาณทศวรรษที่ 1800 กาแฟได้รับการปลูกฝังในประเทศไทย เวียดนาม กัมพูชา และลาวโดยอาณานิคมของฝรั่งเศส ในที่สุดชาวดัตช์ก็ได้รับอนุญาตให้ปลูกกาแฟได้ในช่วงครึ่งหลังของศตวรรษที่ 17 และประสบความสำเร็จกับความพยายามบนเกาะชวา ในพื้นที่ที่ปัจจุบันรู้จักกันในชื่ออินโดนีเซีย และชาวดัตช์เองก็เริ่มมีบทบาทสำคัญในการค้ากาแฟ